Madlaina Degen studierte Viola an der Hochschule für Musik Basel sowie an der Zürcher Hochschule der Künste bei Christoph Schiller und Michel Rouilly. Nach dem Bachelor erlangte sie einen Master in Music Performance und einen Master in Musikpädagogik. Meisterkurse besuchte sie bei Lawrence Power und Helmut Lachenmann. Madlaina Degen war mehrere Jahre Mitglied des Belenus Quartettes und konzertierte mit verschiedenen Kammermusik-Ensembles. Sie ist Preisträgerin der Koeckert- und Kiwanis-Wettbewerbe Zürich.

Erste Orchestererfahrung sammelte sie als Praktikantin im Sinfonieorchester Basel und spielte später in den Sinfonieorchestern Luzern und St. Gallen. Von 2014-2017 war sie als Bratschistin am Theater Magdeburg (Zeitvertrag) engagiert und ist seit 2018 Orchestermitglied am Theater Osnabrück.